中国科学技术大学
中科大的同步辐射实验室是我国第一个建成国家实验室的高校，其实验成果应用在各个领域，对国家的贡献极大。此外，中科大还有合肥微尺度物质科学国家实验室，可以说中科大是我国唯一具有两个国家实验室的高校。作为很早就拥有国家实验室的高校，中科大并没有利用作为宣扬的资本，知道中科大拥有国家实验室的人也不多，可见其实十分的低调。虽然在国内的各种排名当中，中科大排名并不算高，但是在国际排名中，国际机构对其科研实力是十分认可的，所以国际排名往往比较好。
中国海洋大学
在985高校当中，中国海洋大学的排名是比较靠后的，而且知名度也较低。虽然其在综合实力方面不如其他高校，但是不可否认的是其在海洋学科方面的实力是绝对强的，其他高校也无法动摇。
中国海洋大学拥有已经建成的青岛海洋科学与技术国家实验室，这是除中科大以外，唯一一所已经建成国家实验室的高校。从实验室的名字就可以知道，其在海洋科学技术方面的应用是国内最顶尖的水平，其科研成果也直接应用于国家海洋战略的布局，对国家有着重大贡献。
除了上面两所大学已经有建成的国家实验室，还有一些大学正在筹建国家实验室。具体为清华大学（清华信息科学与技术国家实验室）、北京大学（北京分子科学国家实验室）、华中科技大学（武汉光电国家实验室）、南京大学（微结构国家实验室）、上海交通大学（船舶与海洋工程国家实验室）、中国农业大学（现代农业国家实验室）、北京航空航天大学（航空科学与技术国家实验室）、西南交通大学（现代轨道交通国家实验室）。
