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四川大学预算800万进行冷冻电镜数据计算存储平台建设

   2019-02-25 中国政府采购网866
核心提示:四川大学生物治疗国重实验室预算800万元进行冷冻电镜大数据云计算平台及配套设备设施建设。
 日前,中国政府采购网发布四川大学生物治疗国重实验室冷冻电镜平台数据处理及存储计算集群建设采购项目公开招标公告(招标编号:JJCDCG-2018121901;采购人备案编号:SCUSBC-2018043),预算800万元进行冷冻电镜大数据云计算平台及配套设备设施建设,开标时间:2019年03月12日 10:00

  冷冻电镜数据计算存储平台建设项目是四川大学生物治疗国家重点实验室冷冻电镜平台附属配套工程,为今后冷冻电镜大数据存储、计算、在线分析提供支持,项目包括高性能计算功能、大数据存储与在线管理等设备的采购、后期各项应用软件的培训、以及机房环境改造与建设。项目建成后将成为冷冻电镜平台在线三维数据分析处理中心,为科研团队提供冷冻电镜数据的在线计算和存储、以及配套技术服务。

  招标内容如下:

招标公告.png

  招标公告中对项目的需求进行了如下描述:采购、部署一套高性能计算集群,包含计算功能、存储功能、在线数据处理功能、在线远程3DLinux 桌面云功能、校内在线计算与存储功能、集群管理与多用户作业队列管理功能、用户存储配额管理功能、配套机房设施/网络/综合布线系统工程与配套设施设备。计算与存储功能配套的计算机性能要求见配置功能要求。供应商必须提供集群系统的设计、实施、运营维护、售后服务、驻场技术支持服务的详细方案。

  对于冷冻电镜数据处理技术支持服务要求:供应商必须针对冷冻电镜数据采集、预处理、分析处理、三维重构、数据三维可视化等环节设计、部署全自动化数据处理流程(Pipeline),包括但不限于数据收集软件SerialEM、数据处理软件(MotionCor2、CtfFind4、RELION3、EMAN、EMAN2、cryoSPARC、cisTEM)、Tomo 专用软件(IMOD、EMClarity)、以及建模软件(Coot、Rosetta、Phenix、Pymol、CCP4)等具体软件的脚本编写与软件代码级别性能调优。

 
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