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10x Chromium X系列百万单细胞系统重磅上线!

   日期:2021-08-11     浏览:788    
核心提示:近年来,单细胞测序技术的迅速发展和应用推广,为科研人员从多维度揭示生物发育、肿瘤发生发展、感染与免疫,以及药物研究等领
       近年来,单细胞测序技术的迅速发展和应用推广,为科研人员从多维度揭示生物发育、肿瘤发生发展、感染与免疫,以及药物研究等领域的科学问题提供了有力的工具。而在目前商业化的高通量单细胞测序技术之中,10x Genomics的Chromium平台是应用最为广泛的解决方案,助力国内外的科研、转化和应用机构来解决复杂的生物学问题,从而改善人类健康。Chromium单细胞解决方案可从基因表达、染色质可及性、细胞表面蛋白、免疫克隆型、抗原特异性以及CRISPR编辑等多个角度解析生物复杂性,实现真正的单细胞多组学分析。

 

10x Genomics的经典款仪器Chromium Controller,轻巧便携,是您实验室自用、外出服务的必备神器,而于2020年推出的自动化建库工作站Chromium Connect,从细胞悬液到可用于测序的文库,可最大限度地减少不同用户、不同样品甚至不同地点的单细胞数据差异,大大提高实验室效率。

 

 

然而,随着单细胞测序的不断发展,研究人员对能够分析数十万甚至数百万细胞大规模研究的需求不断增加,如研究免疫学和传染病反应,对大脑和神经系统等极其复杂的系统进行深入分析,对整个发育阶段的细胞类型进行完整的图谱分析,以及大规模单细胞 CRISPR 和药物筛选等。而更高通量的研究往往耗时耗力、费用高昂,因此,如今10x Genomics Chromium X系列解决方案应运而生。

 

 

10x Genomics Chromium X是一种新型高通量单细胞测序文库构建解码系统,单次最多运行上百万细胞,可大大降低检测成本。那么它是怎么做到的呢,数据表现又如何?别着急,我们将通过Q&A形式为您一一揭晓~

 

10x Chromium X如何实现单次运行百万单细胞?

与10x 之前推出的两款仪器Chromium Controller和Chromium Connect相同,最新推出的Chromium X系列产品也是基于Next GEM技术研发,其核心之处在于采用先进的微流控技术,可在几分钟内完成成千上万个单细胞微滴生成和条形码标记,而每个微滴都含有一个可识别的条形码,便于下游分析。

而与之前的Controller和Connect两款仪器的8通道,每个通道最多捕获10,000个细胞不同的是,X仪器有16个通道,每个通道最多捕获20,000个细胞,再结合10x的CellPlex多样本混样技术,每个通道最多可捕获60,000个细胞,去除双细胞率后,每张芯片最多可捕获750,000个单细胞。

 

10x Chromium X系列仪器有几款,有什么区别?

10x Chromium X系列仪器有两款,iX和X,两款仪器外观相同,但性能不同。X是最全能的一款仪器,从低通量LT到标准通量Standard到高通量HT全部兼容,具有超高的灵活性,无论是入门级的试点研究,还是进行大规模的超高通量实验,都能完美兼容,并可运行多种应用如单细胞基因表达、免疫分析、ATAC及Multiome;iX可谓是X的入门款,兼容LT和Standard,可通过购买升级包直接升级到X,进而运行高通量试剂盒HT,实现单次运行百万细胞。当然,iX比X价格更低,是一种经济实惠的选择。

 

单次实验这么高的通量,成本究竟能降低多少?

10x Chromium X搭配高通量的试剂盒HT,可使总体实验成本降低70-80%,单个细胞的成本降低多达7倍!

 

使用10x Chromium X仪器的数据表现怎么样?


1. 
在Chromium Controller和X两款仪器上运行标准通量产出数据对比

10x使用Standard标准通量的试剂盒分别在Chromium X和Chromium Controller上进行了不同应用(单细胞基因表达、免疫分析、ATAC及Multiome)的内部测试实验,两者产生的数据非常相似,说明标准通量的试剂在两款仪器上运行可产生基本一致的实验结果。

2. 在10x Chromium X仪器上运行标准通量和高通量试剂产出数据对比

10x使用 Chromium X 和新 HT 试剂盒进行了一项内部研究,以评估 7 种不同的药物化合物对 2 种非小细胞肺癌细胞系随时间的影响。结合CellPlex 技术,将来自相同处理的样品进行混样处理,并在Chromium X 上运行单细胞基因表达Standard和 HT 两种解决方案。基因中位数和UMI检出率以及UMAP图中的聚类分析均表现出高度相似,二者的t-SNE投影图也高度重叠。

然后用基因表达数据来注释细胞群,主要的细胞亚型如 B 细胞、T 细胞、自然杀伤细胞和单核细胞,以及健康的肺细胞和肿瘤细胞,都可以很好地鉴定区分。叠加抗体数据后,健康的肺细胞如肺泡上皮细胞和纤毛细胞,在 HT 和标准方案中都能检测到。但绿色的 ELF3+/EPCAM+ 细胞群仅存在于 HT得到的数据中,而单独使用Standard方案无法检测得到。说明高通量和标准通量可产生可比拟的数据结果,但高通量解决方案比标准通量更能检测出稀有细胞类群。

 

10x Chromium X可以用于哪些应用方向?

10x新的Chromium X 和单细胞高通量 HT 解决方案能够在广泛的研究领域实现新的应用。从对不同患者群体的深度免疫组库分析,到在癌症样本中寻找超稀有的肿瘤细胞,到构建复杂的大脑和神经系统的综合图谱,再到大规模的单细胞 CRISPR 筛选和药物鉴定等。

10x Chromium X系列单细胞系统可以根据您需要的实验规模开展任何10x Genomics单细胞实验,并具有业界最高的通量灵活性,可分析数百至百万级的细胞。俗话说早就是优势,早点迈入单细胞研究的新台阶,解锁10x Chromium X为您带来的无限可能,也就把握了高通量单细胞研究的先动优势。X系列现已接受预定,早预定早发货,欲购从速

 
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