实验室设计不专业的话将会带来以下的麻烦：
1、实验室建成后，无法满足甲方的实际需要。例如：实验室建成后，发现设计中没有考虑到很多问题，包括无法安装仪器，没有水源或电源，或者接口不在设备附近，地面容易被腐蚀花，工作流程不畅，通风不够，空间不够，没有防震设备，温湿度记录与控制不能正常运行，装饰材料不符合需求等。
2、实验室的维护和维修无法正常进行。实验室建成进入试运行时，可能发现很多问题，但是得不到及时纠正，施工单位往往提出这是设计的问题，责任不清。所以，不要采用免费的设计方案，必须找有相关设计经验的公司进行专业设计，签订设计合同，支付合理设计费，避免贪图免费设计而导致后面不合理的工程施工损失更大。
3、实验室设计无法满足进一步发展的需要。按设计图纸施工后，所得到的实验室无法进一步发展，如没有空间安放新的仪器设备，没有安装好电脑接口，使设备无法满足信息化建设的要求。
4、实验室设计不符合消防要求。有些实验室建设过程中没有经过消防审查。
5、 实验室施工结算远远超出预算。这是目前实验室装修中最为常见的问题。如中标480万，结算时却需要600万。还有就是实验室存在职业危害隐患。
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